La Inspección de Servicios del Ministerio de Agricultura, Alimentación y Medio Ambiente y la Fiscalía ya han iniciado los primeros pasos para investigar el inflado en las obras de emergencia del río a su paso por Córdoba, adjudicada a Viguecons Estévez, empresa amiga del comisario de Aguas, Rafael Álvarez Giménez, y Caminos y Cauces por 1,8 millones de euros. Fuentes de la confederación e ingenieros especializados cifran el sobrecoste de esta obra en 900.000 euros, según las tarifas aplicadas por Tragsa, empresa pública dependiente de la SEPI.
La Fiscalía Superior de Andalucía ya ha recibido escritos de funcionarios, enviados de forma anónima por temor a represalias, en los que se explica con detalle el precio de este sobrecoste localizado en una superficie de 79.512 metros cuadrados. Según datos de la confederación sobre las unidades de obra realizadas con sus mediciones correspondientes, fueron retiradas un total de ocho toneladas de residuos urbanos; fueron extraídas 150.000 toneladas (73.258 metros cúbicos) de sedimentos del cauce, lo que dio lugar a la aparición de embarcaderos existentes en el Puente de El Arenal, Molino de Martos y Parque de Miraflores.